La mission de récupération des parchemins secrets des deux ninjas Senshiro et Tasaburo continue. Ce dernier, tombé amoureux de la princesse, s'enfuie avec sa bien-aimée toujours en possession de l'un des rouleaux et Senshiro se lance à sa poursuite..
Les Chroniques Martiales du clan des Yagyû, un parchemin primordial pour garder la paix, ont été volé par le maître d'armes du clan Nabeshima poursuivi par Jûbei Yagyû. Tasaburo, ninja Kasumi de l'école Kage, s'interpose mais le maître d'armes est assassiné par Jûbei, et le parchemin est récupéré par la Pincesse Yû du clan Ryûzôji. Celle-ci pense ainsi avoir trouver un moyen de rétablir son clan dissout. Mais Tasaburo doit à tout prix récupérer le parchemin pour son clan qui ne souhaite que respecter la justice du pays....
Raymond's father is the leader of the Scorpios and he is preparing to hand over the business to his son. Other gang leaders, Phoenix and Anders, know this too well..
During the Ming Dynasty, as Japanese pirates wreak havoc along the Chinese coast, laying waste to entire towns, a band of ninjas start appearing and target the Chinese military commander, General Chi. The Master of the Three Arts (who possesses a book illustrating various ninja techniques) is the only one who can combat this new enemy, so he pledges that his students will join Chi's army in their fight to wipe out the killers..